大豆2S清蛋白基因生物信息學(xué)分析
摘要：2S清蛋白含有動(dòng)物胰蛋白酶抑制劑及過(guò)敏原等多種具有生理活性的多肽,可引起特殊人群尤其是兒童的過(guò)敏反應(yīng),其編碼基因?yàn)長(zhǎng)TP基因家族。為系統(tǒng)地分析2S清蛋白編碼基因,利用生物信息學(xué)分析方法獲得2S清蛋白基因的全序列、定位以及轉(zhuǎn)錄本等信息,鑒定了30個(gè)大豆LTP家族基因。基因定位結(jié)果表明:23. 33%基因在染色體上串聯(lián)排布,反映了該家族基因的串聯(lián)重復(fù)進(jìn)化。通過(guò)基因功能注釋得到22個(gè)非特異性脂質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,1個(gè)類伸展素蛋白,4個(gè)脯氨酸蛋白,2個(gè)種子儲(chǔ)存2S清蛋白和1個(gè)雄蕊特殊蛋白。根據(jù)系統(tǒng)發(fā)育分析將這些蛋白分成3個(gè)類群。類群I有類伸展素蛋白、脯氨酸蛋白、雄蕊特殊蛋白和種子儲(chǔ)存2S清蛋白,類群II有16個(gè)非特異性脂質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,類群III有6個(gè)非特異性脂肪轉(zhuǎn)移蛋白。種子儲(chǔ)存2S清蛋白基因在種子發(fā)育中后期特異表達(dá),表達(dá)量顯著高于其它同源基因。本研究為進(jìn)一步研究其功能提供指導(dǎo),為該類基因應(yīng)用于大豆品質(zhì)改良提供理論支撐。
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大豆科學(xué)雜志
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