摘要:【目的】檢測(cè)從山東青島采集的有“花臉”癥狀的火焰海棠(Malus‘Flame’)果實(shí)是否帶有蘋果銹果類病毒(Apple scar skin viroid,ASSVd)?!痉椒ā刻崛в小盎槨卑Y狀的火焰海棠果皮總RNA,設(shè)計(jì)ASSVd特異性引物,利用RTPCR方法進(jìn)行檢測(cè)。設(shè)計(jì)基因特異性引物擴(kuò)增ASSVd基因組全長(zhǎng),并進(jìn)行克隆、測(cè)序,利用CLC RNAWorkbench4預(yù)測(cè)其二級(jí)結(jié)構(gòu)。用DANMAN軟件比對(duì)來(lái)自中國(guó)不同地區(qū)、不同寄主的蘋果銹果類病毒分離物基因序列。用MEGA-7軟件分析山東火焰海棠ASSVd分離物與來(lái)自不同國(guó)家、不同寄主ASSVd分離物的遺傳關(guān)系。【結(jié)果】從山東青島采集的表現(xiàn)“花臉”癥狀的火焰海棠果皮中檢測(cè)到ASSVd,推測(cè)火焰海棠果皮的“花臉”癥狀可能由ASSVd引起。利用基因特異性引物克隆4條ASSVd基因組全長(zhǎng)序列,其長(zhǎng)度為333~334 bp,在GenBank的登錄號(hào)依次為MK102981-MK102984。ASSVd序列比對(duì)結(jié)果顯示,來(lái)源于不同寄主的分離物存在差異。系統(tǒng)進(jìn)化樹顯示ASSVd不存在明顯的地區(qū)?;?進(jìn)一步對(duì)ASSVd二級(jí)結(jié)構(gòu)分析發(fā)現(xiàn)不同寄主的ASSVd致病區(qū)(P)存在明顯的差異?!窘Y(jié)論】從山東青島采集的帶有“花臉”癥狀的火焰海棠果實(shí)帶有ASSVd。本研究從火焰海棠檢測(cè)到ASSVd,明確其為自然寄主之一,且火焰海棠果實(shí)的“花臉”癥狀形成可能與ASSVd侵染有關(guān)。
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