應(yīng)用單核苷酸多態(tài)性(SNP)標(biāo)記鑒定短頜鱭、湖鱭和刀鱭
摘要：為了快速區(qū)分長江流域各水體中的鱭屬魚類,利用單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphism,SNP)標(biāo)記對短頜鱭(Coilia brachygnathus)、湖鱭(C. nasus taihuensis)和刀鱭(C. nasus)進行物種鑒定。從120個在短頜鱭和刀鱭之間分化指數(shù)(Fst)為1的SNP位點中隨機挑選出20個用于引物設(shè)計,從21個在湖鱭和刀鱭之間分化指數(shù)較高的SNP位點中隨機挑選出10個設(shè)計引物。隨機挑20尾短頜鱭、20尾湖鱭和12尾刀鱭用設(shè)計的引物擴增、測序。結(jié)果表明:洞庭湖和鄱陽湖的短頜鱭與刀鱭可以使用以上19個SNP分子標(biāo)記中的任何一個完全分開,剩下1個SNP標(biāo)記在所擴增的樣本中沒有發(fā)現(xiàn)多樣性變異而被棄用。用于區(qū)分湖鱭與刀鱭的10個SNP分子標(biāo)記中有8個在所測樣本中可以擴增并用于物種鑒定。其中單獨使用Ct-Cn_wtap位點時,湖鱭和刀鱭的基因頻率相差最大,當(dāng)使用Ct-Cn_wtap和Ct-Cn_eif2b4位點時,對湖鱭和刀鱭的鑒別準(zhǔn)確率可以達到100%。本研究提供了穩(wěn)定、高效和低成本識別短頜鱭和刀鱭、湖鱭和刀鱭的方法,為今后鱭屬魚類的物種鑒定和資源保護提供了有效的工具。
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上海海洋大學(xué)學(xué)報雜志， 雙月刊，本刊重視學(xué)術(shù)導(dǎo)向，堅持科學(xué)性、學(xué)術(shù)性、先進性、創(chuàng)新性，刊載內(nèi)容涉及的欄目：水產(chǎn)生物技術(shù)、水產(chǎn)養(yǎng)殖、水產(chǎn)營養(yǎng)與飼料、水域環(huán)境與保護、漁業(yè)資源與可持續(xù)捕撈、漁業(yè)工程、水產(chǎn)食品科學(xué)、海洋藥物等。于1992年經(jīng)新聞總署批準(zhǔn)的正規(guī)刊物。
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