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計算生物學(xué)分析在基因組編輯研究中的應(yīng)用

作者:王瀅; 熊義春; 陳佳; 楊力 中國科學(xué)院計算生物學(xué)重點實驗室、中國科學(xué)院-德國馬普學(xué)會計算生物學(xué)伙伴研究所、中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院營養(yǎng)與健康研究院; 中國科學(xué)院大學(xué); 上海200031; 上海科技大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院; 上海200031

摘要:基因組編輯是對基因組遺傳信息進行定向改造的技術(shù),其中CRISPR/Cas系統(tǒng)是目前應(yīng)用最廣泛的基因組編輯新技術(shù)。將先進的高通量測序以及相關(guān)計算生物分析應(yīng)用于基因編輯研究,可進一步優(yōu)化基因編輯效率和精度等檢測流程,實現(xiàn)對全基因組功能基因篩選的監(jiān)測。同時,利用基于生物信息及機器學(xué)習(xí)和深度學(xué)習(xí)等新方法,可對向?qū)NA(gRNA)的高效設(shè)計和實現(xiàn)對編輯效果的預(yù)測。本文將對計算生物學(xué)分析在CRISPR/Cas基因編輯系統(tǒng)的應(yīng)用及研究進展等進行概述。

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生命的化學(xué)雜志, 月刊,本刊重視學(xué)術(shù)導(dǎo)向,堅持科學(xué)性、學(xué)術(shù)性、先進性、創(chuàng)新性,刊載內(nèi)容涉及的欄目:綜述、研究論文、技術(shù)與方法、教學(xué)等。于1980年經(jīng)新聞總署批準的正規(guī)刊物。

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