一株湖北HP-PRRSV分離株nsp2基因遺傳變異分析
摘要：為了解湖北地區(qū)豬繁殖與呼吸綜合征病毒（PRRSV）的遺傳變異情況和分子流行病學(xué)情況,從湖北地區(qū)某豬場采集疑似病料進行處理，接種Marc-145細胞，待細胞發(fā)生病變后收獲病毒，提取病毒總RNA,應(yīng)用RT-PCR法對PRRSV nsp2部分基因進行擴增,經(jīng)序列測定，并與美洲株VR-2332、歐洲株Lelystad virus及國內(nèi)各PRRSV分離株進行核苷酸及其推導(dǎo)的氨基酸進行同源性比較，并繪制系統(tǒng)進化樹。結(jié)果表明，經(jīng)RT-PCR擴增獲得了PRRSV湖北分離株（命名為HDZZ1）的nsp2基因，核苷酸序列分析顯示，獲得的nsp2核苷酸與VR-2332的同源性為77.7%，與Lelystad virus的同源性為44.3%。其氨基酸與VR-2332的同源性為64.58%，與Lelystad virus的同源性為13.93%。證明所獲得PRRSV仍為美洲型。與我國分離的高致病性PRRSV毒株07BJ、BJ0708、GD、GDYC、HEB1、Henan-1、 HN- HW、HPBEDV、HUB1、HUN4、JXA1、SX-1、SX2009核苷酸同源性高達97.3%～98.8%，氨基酸同源性為 96.40%～ 98.8%，氨基酸序列分析結(jié)果顯示，Nsp2蛋白在222位和274-302位兩處出現(xiàn)了30個氨基酸的不連續(xù)缺失，其Nsp2蛋白的抗原表位發(fā)生了改變。系統(tǒng)發(fā)生樹結(jié)果表明, HDZZ1株與高致病性PRRSV毒株位于同一大分支中，與歐洲代表株（Lv）、美國NADC30株和國內(nèi)NADC30-likeHNjz15株處于不同分支中。由此斷定,HDZZ1毒株為高致病性PRRSV毒株。
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