云南玉龍與青藏高原鼠疫菌差異序列的比對(duì)研究
摘要：目的觀察云南玉龍鼠疫菌株D106004和青藏高原鼠疫菌株Z176003在基因組上的差異及遺傳學(xué)特征。方法應(yīng)用BLAST軟件,將鼠疫D106004和Z176003菌株編碼序列(CDS)進(jìn)行差異比對(duì)。選取22個(gè)差異CDS,設(shè)計(jì)相應(yīng)引物22對(duì),在來源不同(青藏高原喜馬拉雅旱獺鼠疫自然疫源地和云南齊氏姬鼠、大絨鼠鼠疫自然疫源地)、時(shí)間跨度約50年、分布地區(qū)包括西藏、青海、四川、甘肅、云南的6種生態(tài)型119株鼠疫代表性菌株進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并將PCR產(chǎn)物測(cè)序驗(yàn)證。菌株均來自中國(guó)疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所傳染病預(yù)防控制國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室。結(jié)果119株鼠疫代表性菌株的22個(gè)差異CDS,PCR擴(kuò)增產(chǎn)物實(shí)際測(cè)序結(jié)果累計(jì)序列長(zhǎng)度為2.13 × 10^6 bp;差異CDS在云南玉龍D106004與青藏高原Z176003菌株所屬疫源地內(nèi)119株鼠疫代表性菌株中同源性較高,78.2%(2 047/2 618)序列不存在差異,21.8%(571/2 618)序列上存在缺失、錯(cuò)義、移碼3類基因突變差異。差異特征在疫源地6種生態(tài)型鼠疫菌株中穩(wěn)定存在,呈現(xiàn)6種不同的地理分布。結(jié)論云南玉龍D106004和青藏高原Z176003菌株,二者同源性較高,親緣關(guān)系相近,基因組上存在的差異較小,但不同生態(tài)型菌株的遺傳性特征穩(wěn)定存在.
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中華地方病學(xué)雜志
中華地方病學(xué)雜志， 月刊，本刊重視學(xué)術(shù)導(dǎo)向，堅(jiān)持科學(xué)性、學(xué)術(shù)性、先進(jìn)性、創(chuàng)新性，刊載內(nèi)容涉及的欄目：述評(píng)、論著、調(diào)查報(bào)告、檢測(cè)方法、綜述、講座、經(jīng)驗(yàn)介紹。等。于1982年經(jīng)新聞總署批準(zhǔn)的正規(guī)刊物。
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