瞬時(shí)受體電位M8型離子通道選擇性濾器的三維結(jié)構(gòu)計(jì)算建模
摘要：目的:構(gòu)建瞬時(shí)受體電位M8型(TRPM8)離子通道選擇性濾器結(jié)構(gòu)域的三維結(jié)構(gòu)模型。方法:在Rosetta計(jì)算結(jié)構(gòu)生物學(xué)工具包中,使用基于運(yùn)動(dòng)回路閉合算法的從頭計(jì)算,對(duì)TRPM8離子通道選擇性濾器結(jié)構(gòu)域進(jìn)行多輪計(jì)算建模。結(jié)果:經(jīng)過(guò)9輪計(jì)算得到了能量最低且結(jié)構(gòu)收斂的TRPM8通道選擇性濾器結(jié)構(gòu)域的三維結(jié)構(gòu)模型,發(fā)現(xiàn)D918位點(diǎn)的側(cè)鏈并不指向離子流過(guò)的孔區(qū)中心,而Q914、D920和T923位點(diǎn)的側(cè)鏈指向孔區(qū)中心;糖基化位點(diǎn)N934位于孔區(qū)外側(cè),其側(cè)鏈指向胞外水環(huán)境。結(jié)論:構(gòu)建了TRPM8通道選擇性濾器結(jié)構(gòu)域的三維結(jié)構(gòu)模型,為理解該通道的離子選擇性及相關(guān)機(jī)制提供了較為可靠的結(jié)構(gòu)信息。
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